استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای مطالعه پروتئین مایوستاتین

ژن مایوستاتین متعلق به خانواده فاکتورهای تمایز رشد (tgf-β) می­باشد که در رشد و نمو و بلوغ و به­طور اختصاصی در توسعه ماهیچه اسکلتی بالغ بیان می­شود. در این پژوهش با بهره­ گیری از نرم­افزارهای بیوانفورماتیکی، توالی­ اسیدآمینه­ای پروتئین مایوستاتین در گونه­های مختلف ازجمله گاو، گوسفند، بز، اسب، خوک، مرغ، بوقلمون، اردک، غاز، کبوتر، موش و انسان بررسی شد. در هم­ردیفی بخش پایانی پروتئین مایوستاتین (فرم فعال پروتئین مایوستاتین که به­صورت دایمر بیان می­شود)، درجه بالایی از حفاظت شدگی مشاهده شد، به­طوری­که نوسان تغییرات در این بخش نسبت به سایر قسمت‏های توالی پروتئینی، کمترین مقدار ممکن بود. با استفاده از سایت­های تخصصی proteus و phyre2 ساختارهای ثانویه­ای از قبیل مارپیچ آلفا، صفحات بتا و ساختار سه بعدی پروتئین مایوستاتین مورد بررسی قرار گرفت. اسیدآمینه­های لوسین، لیزین، ایزولوسین و گلوتامیک اسید در گاو و گوسفند و بز فراوانی یکسانی را نشان دادند اما در مقایسه با ماکیان مانند مرغ، فراوانی بیشتری داشتند. حال آن­که فراوانی این اسیدآمینه­ها در توالی پروتئینی مایوستاتین انسان و خوک متوسط بود. بررسی درخت فیلوژنی نشان داد که تفاوت در توالی اسیدآمینه­ای مایوستاتین در بین گونه­های یاد شده باعث قرار گرفتن پرندگان در گروهی جدا شده از پستانداران شده است. بررسی ساختار سه بعدی نشان داد که ژن مایوستاتین دارای حفاظت شدگی بالایی در گونه ‏ها است.